باز کردن ویژگی های اصلی خطوط سلولی و ایجاد یک پایه محکم برای صنعتی شدن
فناوری توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) ارائه می‌دهدراه حل های جامع تجزیه و تحلیل خطوط سلولی با قابلیت های پوشش عمیق آن، امکان تحقیقات سیستماتیک در مورد ویژگی های ژنتیکی، نشانگرهای هویت و پیشینه ایمنی رده های سلولی مختلف را فراهم می کند. این پشتیبانی از داده های دقیق را برای غربالگری خطوط سلولی، اعتبارسنجی، کاربرد و کنترل کیفیت فراهم می کند.
کل -ژنوم NGSتوالی یابی
با بکارگیری فناوری توالی‌یابی ژنوم با عمق بالا-کل-، همراه با یک پلت فرم پیشرفته تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک، می‌توانیم به درک جامع و دقیقی از خطوط سلولی دست یابیم:
پوشش عمق-بالا
عمق توالی‌یابی می‌تواند به بزرگ‌تر یا مساوی 50× برسد و از گرفتن اطلاعات کلیدی مانند انواع ژن‌های-با فراوانی کم و توالی‌های درج شده اطمینان حاصل کند.
تجزیه و تحلیل چند بعدی-
ادغام داده‌های چند سطحی مانند ژنوم و رونوشت، ارائه تجزیه و تحلیل جامع از ابعاد ویژگی‌های ژنتیکی، ویژگی‌های عملکردی و خطرات ایمنی؛
فرآیندهای استاندارد
با رعایت دقیق استانداردهای کنترل کیفیت آزمایشگاهی، فرآیند تجزیه و تحلیل داده ها قابل ردیابی و تکرار است و از صحت و قابلیت اطمینان نتایج اطمینان حاصل می کند.
تست محتوا
• عملکرد اصلی: با شناسایی توالی‌های خط سلولی{0}}خاص تکرار پشت سر هم (STR) و مقایسه آنها با پایگاه‌های داده استاندارد بین‌المللی (مانند ATCC و DSMZ)، می‌توان صحت هویت خط سلول را تأیید کرد.
• مزایای تشخیص: تشخیص دقیق منشاء خطوط سلولی و جلوگیری از آلودگی متقابل-(مانند سردرگمی بین خطوط سلولی انسان و موش) تضمین اصلی برای قابلیت اطمینان داده ها و انطباق صنعتی است.
توابع اصلی: تشخیص دقیق محل درج، تعداد کپی و یکپارچگی توالی ژن هدف در رده های سلولی مهندسی شده ژنتیکی (مانند خطوط سلولی بیان پروتئین نوترکیب و خطوط سلولی ویرایش کننده ژن).
• تشخیص جهش ژنی: غربالگری جامع ناهنجاری های ژنتیکی مانند جهش های ژنی (SNV)، تغییرات تعداد کپی (CNV) و تغییرات ساختاری (SV) در رده های سلولی، و تجزیه و تحلیل ارتباط بین فنوتیپ رده سلولی و ویژگی های ژنتیکی.
• تجزیه و تحلیل یکپارچگی کروموزومی: تغییرات ساختاری مانند تعداد کروموزوم های غیر طبیعی، جابجایی و حذف را تشخیص می دهد و ثبات ژنتیکی رده های سلولی را ارزیابی می کند.
• تجزیه و تحلیل ژن عملکردی: تجزیه و تحلیل ویژگی های بیان و مکانیسم های تنظیمی ژن های مربوط به عملکردهای رده سلولی اصلی (مانند ژن های تکثیر، تمایز و متابولیسم) برای ارائه جهت برای بهینه سازی خط سلولی.
انواع خطوط سلولیپوشیده شده است
خطوط سلولی مهندسی شده
رده‌های سلولی بیان پروتئین نوترکیب (CHO، HEK293)، خطوط سلولی ویرایش‌کننده ژن (سلول‌های اصلاح‌شده CRISPR/Cas9)، خطوط سلولی مهندسی شده با خودرو، و غیره.
خطوط سلول های بنیادی
تجزیه و تحلیل پایداری ژنتیکی و پتانسیل تمایز سلول های بنیادی جنینی (ESC)، سلول های بنیادی پرتوان القایی (iPSC)، سلول های بنیادی مزانشیمی (MSC).
خطوط سلولی معمولی
شناسایی، غربالگری آلودگی و تأیید ویژگی های ژنتیکی رده های سلولی آزمایشی معمول مورد استفاده در تحقیقات علمی (مانند HeLa، A549، MCF-7).
سناریوهای کاربردی
مرحله تحقیق پایه
احراز هویت خط سلولی، تجزیه و تحلیل ویژگی های ژنتیکی، و بهینه سازی پروتکل تجربی برای اطمینان از صحت و تکرارپذیری داده ها؛
تحقیق و توسعه بیودارویی
ساخت و غربالگری رده سلولی نوترکیب، تأیید درج ژن هدف، و نظارت بر ثبات خط سلولی، کمک به توسعه داروهای پروتئینی و داروهای آنتی بادی.
در زمینه سلول درمانی
ارزیابی پایداری ژنتیکی رده های سلول های بنیادی و رده های سلولی مهندسی شده، شناسایی خطرات ایمنی، و ارائه پشتیبانی انطباق برای کاربردهای بالینی؛
مرحله کنترل کیفیت
نظارت بر ثبات، تأیید سازگاری هویت، و بررسی آلودگی در طول عبور از خط سلول برای اطمینان از انطباق فرآیند تولید.